More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0660 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  98.67 
 
 		 350 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  98.67 
 
 		 350 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  98.67 
 
 		 350 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  98.67 
 
 		 350 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  98.67 
 
 		 350 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 350 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  97.33 
 
 		 240 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0660  IS1470, transposase  100 
 
 		 75 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0555532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  96 
 
 		 350 aa  154  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  72.46 
 
 		 356 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  69.01 
 
 		 347 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  69.01 
 
 		 347 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  69.01 
 
 		 347 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  53.12 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  53.12 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  53.12 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  46.48 
 
 		 343 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  43.24 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1654  IS30 family transposase  43.06 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  42.65 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  46.88 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 342 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  38.57 
 
 		 317 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  43.08 
 
 		 386 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  39.71 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  39.71 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  41.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  43.75 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  43.75 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 466 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  38.46 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  39.71 
 
 		 453 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 479 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 479 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 479 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 386 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 386 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  41.54 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  41.54 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 313 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  41.94 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  41.94 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  41.94 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>