More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0447 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  97.04 
 
 		 169 aa  304  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  48.8 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  48.8 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  39.02 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  39.63 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  32.75 
 
 		 232 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  36.71 
 
 		 207 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  36.88 
 
 		 207 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  31.21 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  28.67 
 
 		 206 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.56 
 
 		 228 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  31.1 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 		 325 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.83 
 
 		 216 aa  85.1  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 216 aa  84  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  31.85 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.25 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  32.03 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  33.54 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  32.58 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  32.58 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  32.58 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.07 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  31.82 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  32.58 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.21 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  34.01 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  32.58 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.49 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.09 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  33.11 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  31.82 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  31.82 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  31.88 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  32.33 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  33.1 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.79 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  30.37 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  31.47 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  30.3 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  35.71 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  30.3 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  31.33 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.73 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.9 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.19 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  28.08 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  27.94 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  32.17 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.6 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  30.72 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  27.94 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.88 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.45 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  30.12 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  30.12 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.53 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.56 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.15 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  33.75 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  30.12 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  28.77 
 
 		 198 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  32.39 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  30.37 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>