59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0446 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0456  hypothetical protein  95.38 
 
 
606 aa  1046    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000703218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0446  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1183    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0398916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  27.23 
 
 
636 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1877  hypothetical protein  24.68 
 
 
641 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.044001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  21.38 
 
 
640 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  20.56 
 
 
620 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  30.11 
 
 
345 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0763  hypothetical protein  24.65 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  31.94 
 
 
345 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  25.32 
 
 
708 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.02 
 
 
708 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1595  hypothetical protein  26.67 
 
 
302 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00569706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 
697 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  25.57 
 
 
717 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  28.02 
 
 
726 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.65 
 
 
698 aa  55.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  29.03 
 
 
653 aa  54.3  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.2 
 
 
653 aa  53.9  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  26.8 
 
 
717 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  26.25 
 
 
733 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.72 
 
 
725 aa  52  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  28.36 
 
 
691 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  20.93 
 
 
672 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  24.38 
 
 
625 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  23.84 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  26.97 
 
 
727 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  30.71 
 
 
649 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.08 
 
 
730 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  29.08 
 
 
700 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  24.52 
 
 
687 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.82 
 
 
727 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.99 
 
 
727 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.99 
 
 
727 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.99 
 
 
727 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  24.03 
 
 
369 aa  47.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.83 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.06 
 
 
756 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  26.74 
 
 
659 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  24.66 
 
 
679 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.08 
 
 
700 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  23.93 
 
 
659 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  30 
 
 
653 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.87 
 
 
670 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  29.27 
 
 
733 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  29.27 
 
 
733 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  28.75 
 
 
359 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  20.06 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.46 
 
 
734 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  27.22 
 
 
883 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  22.29 
 
 
664 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  22.11 
 
 
727 aa  44.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.23 
 
 
724 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  24.82 
 
 
679 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.58 
 
 
851 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.99 
 
 
740 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.07 
 
 
338 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  27.78 
 
 
721 aa  43.9  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  26.71 
 
 
352 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.88 
 
 
806 aa  43.5  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>