73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0236 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0239  dnaJ domain-containing protein  97.16 
 
 
422 aa  765    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0101832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0236  dnaJ domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  811    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0854042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4385  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.23 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3114  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.64 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000358037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0091  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.17 
 
 
1061 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.387859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0260  DnaJ domain-containing protein  23.4 
 
 
605 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0282  heat shock protein DnaJ domain protein  22.87 
 
 
600 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0427215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  42.62 
 
 
309 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
383 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0271  heat shock protein DnaJ domain protein  22.87 
 
 
565 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
385 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  39.34 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.1 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  35.48 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
373 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  35.48 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.66 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16800  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  37.29 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  35.48 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  40.32 
 
 
311 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
379 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
374 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0565  heat shock protein DnaJ domain protein  38.33 
 
 
296 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  35.48 
 
 
299 aa  43.9  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  40.32 
 
 
634 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  38.71 
 
 
379 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
374 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
376 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  34.38 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  35.48 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2613  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.07 
 
 
218 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>