23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0110 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1031    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0108  hypothetical protein  92.9 
 
 		 521 aa  912    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1797  hypothetical protein  48.15 
 
 		 368 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1516  hypothetical protein  46.85 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.227418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1568  hypothetical protein  37.97 
 
 		 291 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00354589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2761  hypothetical protein  33 
 
 		 288 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4171  hypothetical protein  33.1 
 
 		 288 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0571677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4132  hypothetical protein  32.39 
 
 		 272 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4194  hypothetical protein  32.39 
 
 		 288 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3892  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0383  protein of unknown function DUF1002  35.04 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4284  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3818  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3803  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4083  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000236834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1067  hypothetical protein  32.75 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  0.659791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3973  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2241  protein of unknown function DUF1002  34.44 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000812091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2358  hypothetical protein  29.62 
 
 		 303 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1524  protein of unknown function DUF1002  27.55 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.759287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0097  hypothetical protein  26.51 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152524 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0963  hypothetical protein  27.86 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0450638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1253  hypothetical protein  31.72 
 
 		 322 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>