78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0011 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0011  hypothetical protein  100 
 
 
918 aa  1861    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0011  hypothetical protein  98.47 
 
 
918 aa  1836    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2146  protein of unknown function UPF0182  36.93 
 
 
912 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1797  hypothetical protein  36.68 
 
 
932 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10710  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.55 
 
 
917 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1139  hypothetical protein  33.87 
 
 
909 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.827602  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1161  hypothetical protein  36.17 
 
 
914 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.100714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2689  hypothetical protein  36.22 
 
 
890 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.958793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2777  protein of unknown function UPF0182  37.37 
 
 
960 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.740282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2333  hypothetical protein  34.57 
 
 
894 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4385  hypothetical protein  34.65 
 
 
919 aa  575  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3567  hypothetical protein  35.68 
 
 
900 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00412787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0902  hypothetical protein  34.71 
 
 
892 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2279  protein of unknown function UPF0182  33.86 
 
 
896 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000442741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0814  protein of unknown function UPF0182  34.01 
 
 
891 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.297672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1115  hypothetical protein  35.03 
 
 
930 aa  555  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
899 aa  548  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939701  normal  0.0211961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3465  protein of unknown function UPF0182  32.59 
 
 
896 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0908  protein of unknown function UPF0182  31.88 
 
 
945 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.747504  hitchhiker  0.000109139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0693  protein of unknown function UPF0182  36.47 
 
 
909 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0967  protein of unknown function UPF0182  32.95 
 
 
959 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000819285  normal  0.392007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3693  hypothetical protein  34.71 
 
 
996 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1951  hypothetical protein  35.05 
 
 
988 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1700  protein of unknown function UPF0182  31.82 
 
 
893 aa  488  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0938  hypothetical protein  35.14 
 
 
1019 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  35.41 
 
 
1004 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2722  hypothetical protein  35.24 
 
 
991 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177747  hitchhiker  0.000114433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  35.16 
 
 
1004 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1783  hypothetical protein  34.45 
 
 
955 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.890136  normal  0.25047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5177  hypothetical protein  33.61 
 
 
1009 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3730  protein of unknown function UPF0182  28.75 
 
 
968 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2749  hypothetical protein  29.12 
 
 
1006 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0945  hypothetical protein  30.4 
 
 
1035 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203937  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  29.49 
 
 
983 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2471  protein of unknown function UPF0182  28.85 
 
 
985 aa  439  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000003677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0698  protein of unknown function UPF0182  33.98 
 
 
945 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00837363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0961  hypothetical protein  30.04 
 
 
872 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0949388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4222  protein of unknown function UPF0182  28.19 
 
 
985 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1871  protein of unknown function UPF0182  27.67 
 
 
949 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14990  hypothetical protein  26.67 
 
 
1047 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.589114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2952  hypothetical protein  28.66 
 
 
972 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0447926  normal  0.518899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3781  hypothetical protein  28.7 
 
 
1018 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568022  normal  0.0630741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1193  protein of unknown function UPF0182  28.32 
 
 
1019 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111199  normal  0.0369409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3729  hypothetical protein  27.41 
 
 
994 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14611  hypothetical protein  32.25 
 
 
950 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1151  hypothetical protein  30.89 
 
 
932 aa  389  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4110  hypothetical protein  27.62 
 
 
993 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0793  protein of unknown function UPF0182  27.58 
 
 
1007 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2137  hypothetical protein  29.13 
 
 
874 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0489156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27470  hypothetical protein  26.74 
 
 
1012 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1599  protein of unknown function UPF0182  27.94 
 
 
982 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217724  normal  0.364231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2885  protein of unknown function UPF0182  27.57 
 
 
980 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0941  hypothetical protein  27.86 
 
 
1001 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3795  protein of unknown function UPF0182  27.19 
 
 
1007 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214749  normal  0.0401617 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0780  Na+-driven multidrug efflux pump  27.25 
 
 
1079 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19060  hypothetical protein  25.57 
 
 
1045 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.569882  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19540  hypothetical protein  26.23 
 
 
1029 aa  363  7.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0653  hypothetical protein  26.87 
 
 
1016 aa  361  3e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.523938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07660  hypothetical protein  26.51 
 
 
988 aa  360  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.580652  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0725  protein of unknown function UPF0182  26.13 
 
 
1018 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2716  hypothetical protein  29.66 
 
 
992 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107653  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1323  hypothetical protein  27.84 
 
 
914 aa  344  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.707425  normal  0.117445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13213  hypothetical protein  26.98 
 
 
992 aa  338  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4654  hypothetical protein  27.19 
 
 
1004 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344019  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1814  hypothetical protein  26.3 
 
 
1002 aa  332  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693843  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1469  hypothetical protein  26.2 
 
 
1001 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1433  hypothetical protein  26.4 
 
 
1003 aa  325  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207138  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1415  hypothetical protein  26.4 
 
 
1003 aa  325  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7927  protein of unknown function UPF0182  25.15 
 
 
962 aa  319  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3487  protein of unknown function UPF0182  27.06 
 
 
994 aa  318  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3037  protein of unknown function UPF0182  25.69 
 
 
985 aa  313  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4377  hypothetical protein  24.98 
 
 
992 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1530  hypothetical protein  24.31 
 
 
1004 aa  307  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2461  protein of unknown function UPF0182  25.81 
 
 
1000 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.947136  hitchhiker  0.00000899121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10064  transmembrane protein  30.68 
 
 
672 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.849211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0541  hypothetical protein  28.48 
 
 
1018 aa  224  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0067  hypothetical protein  21.52 
 
 
953 aa  64.7  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10063  transmembrane protein  24.44 
 
 
346 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.477127  normal  0.782331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>