More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2528 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0068  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2517  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00884396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2527  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2528  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0071  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0090  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2221  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2231  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2232  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0043  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0035  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0289438  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0044  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243599  hitchhiker  0.00307567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0048  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0043  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0056  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0054  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0008  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00012117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0061  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0034  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000195804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0064  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0329997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0032  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0037  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000219335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0060  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000424402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0037  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.813487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0055  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0061  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0036  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000208543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0061  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000433074  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0034  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0059  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000364263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0060  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000089379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0014  tRNA-Phe  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0048  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>