53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2233 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1945  asparagine synthetase AsnA  98.51 
 
 
336 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2233  asparagine synthetase AsnA  100 
 
 
336 aa  691    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0069  asparagine synthetase AsnA  67.86 
 
 
340 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000244111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2575  asparagine synthetase AsnA  66.07 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00216913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3449  asparagine synthetase AsnA  63.69 
 
 
337 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1427  asparagine synthetase AsnA  65.44 
 
 
327 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1786  asparagine synthetase AsnA  63.77 
 
 
353 aa  442  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000156633  hitchhiker  2.77928e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1588  aspartate/ammonia ligase  61.79 
 
 
336 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0946  aspartate/ammonia ligase  62.5 
 
 
337 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1703  asparagine synthetase AsnA  61.26 
 
 
335 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1885  asparagine synthetase AsnA  62.28 
 
 
336 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000727816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3523  asparagine synthetase AsnA  63.91 
 
 
327 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1819  asparagine synthetase AsnA  63.91 
 
 
327 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.631183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1620  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1655  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1673  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1853  asparagine synthetase AsnA  63.3 
 
 
327 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04315e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1808  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1928  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1880  asparagine synthetase AsnA  63.61 
 
 
327 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.701905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1672  asparagine synthetase AsnA  63.3 
 
 
327 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.408642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24030  asparagine synthetase AsnA  57.96 
 
 
335 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.528692  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1444  asparagine synthetase AsnA  55.36 
 
 
336 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0084  asparagine synthetase AsnA  55.89 
 
 
333 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0424  asparagine synthetase AsnA  52.35 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.543605  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0372  asparagine synthetase AsnA  54.58 
 
 
329 aa  321  9.000000000000001e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1440  asparagine synthetase AsnA  50.48 
 
 
333 aa  321  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.797246  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44902  predicted protein  48.67 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0450  asparagine synthetase AsnA  52.05 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000314133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4245  asparagine synthetase AsnA  49.53 
 
 
330 aa  318  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4535  asparagine synthetase AsnA  49.84 
 
 
330 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0817  asparagine synthetase AsnA  50.76 
 
 
326 aa  317  2e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.321948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4214  asparagine synthetase AsnA  50.82 
 
 
330 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0003  asparagine synthetase AsnA  50.82 
 
 
330 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000347674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0003  asparagine synthetase AsnA  50.82 
 
 
330 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.52429  normal  0.646496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4269  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.179504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4089  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4210  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4104  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000041544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4120  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0853611  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4160  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.340951  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4905  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000321879  hitchhiker  0.000612587 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4223  aspartate/ammonia ligase  49.35 
 
 
330 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3960  asparagine synthetase AsnA  49.35 
 
 
330 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4250  asparagine synthetase AsnA  49.35 
 
 
330 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0372107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5180  asparagine synthetase AsnA  49.03 
 
 
330 aa  308  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0230028  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4177  asparagine synthetase AsnA  49.03 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4112  asparagine synthetase AsnA  48.7 
 
 
330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0106172  normal  0.169697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03572  hypothetical protein  49.03 
 
 
330 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.409698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03628  asparagine synthetase AsnA  49.03 
 
 
330 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.312076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4260  asparagine synthetase AsnA  48.7 
 
 
330 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.148939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0576  asparagine synthetase AsnA  42.62 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18911  aspartate--ammonia ligase  40.34 
 
 
387 aa  252  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>