26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2217 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2217  sporulation protein YunB  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1929  sporulation protein YunB  97.38 
 
 
229 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2044  hypothetical protein  32.2 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1694  sporulation protein YunB  26.54 
 
 
221 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1367  hypothetical protein  30.11 
 
 
223 aa  118  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0931  hypothetical protein  30.73 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1810  sporulation protein YunB  33.33 
 
 
280 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00277284  normal  0.063266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1648  hypothetical protein  28.78 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.642219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1759  hypothetical protein  31.33 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.194766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2387  sporulation protein YunB  30.32 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.218046  normal  0.478037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1708  hypothetical protein  27.66 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025642  normal  0.162249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4798  sporulation protein YunB  27.35 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5118  hypothetical protein  25.68 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3570  sporulation protein YunB  24.22 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0122  hypothetical protein  25.76 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.452656  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5111  hypothetical protein  23.87 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4842  hypothetical protein  22.87 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5207  hypothetical protein  22.87 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4684  hypothetical protein  22.87 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4700  hypothetical protein  23.81 
 
 
243 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05710  Sporulation protein YunB  29.28 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5116  hypothetical protein  22.27 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5078  hypothetical protein  24.61 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0396  hypothetical protein  31.16 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2910  sporulation protein YunB  23.38 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3058  sporulation protein YunB  22.87 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>