41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2032 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1749  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2032  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2240  hypothetical protein  62.03 
 
 
88 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000064061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1208  hypothetical protein  58.97 
 
 
84 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0151  hypothetical protein  57.83 
 
 
90 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.492009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0963  hypothetical protein  54.88 
 
 
88 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0422  hypothetical protein  60.26 
 
 
85 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0937  hypothetical protein  57.5 
 
 
86 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2489  hypothetical protein  53.66 
 
 
88 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1643  hypothetical protein  52.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728381  normal  0.0938618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4234  hypothetical protein  54.88 
 
 
88 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00524677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1779  hypothetical protein  56.58 
 
 
93 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0947344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0729  hypothetical protein  54.88 
 
 
88 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000168535  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0534  hypothetical protein  57.32 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4283  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000162571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4467  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4120  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4507  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4520  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000454127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4131  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4615  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05760  hypothetical protein  57.14 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1439  hypothetical protein  54.88 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0101265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4470  hypothetical protein  52.44 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000411363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3100  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0237421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1166  hypothetical protein  56.41 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1490  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000441821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0469  hypothetical protein  52.63 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000774698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2298  hypothetical protein  53.16 
 
 
88 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1937  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000292533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1181  hypothetical protein  49.37 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2091  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000383678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0557  hypothetical protein  53.25 
 
 
83 aa  87.8  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0137  hypothetical protein  48.72 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1674  hypothetical protein  48.75 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2025  hypothetical protein  46.43 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1708  hypothetical protein  48.75 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3564  hypothetical protein  55.42 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000346285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2267  hypothetical protein  53.73 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000479382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0773  hypothetical protein  53.49 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000443524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0913  hypothetical protein  53.75 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.137072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>