50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1877 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1877  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1259    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.044001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1595  hypothetical protein  98.01 
 
 		 302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00569706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1596  hypothetical protein  92.55 
 
 		 192 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0019786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  25.79 
 
 		 620 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0456  hypothetical protein  24.35 
 
 		 606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000703218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  24.02 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0446  hypothetical protein  25.05 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0398916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  23.48 
 
 		 636 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  31.47 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 345 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.22 
 
 		 740 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0763  hypothetical protein  23.01 
 
 		 667 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00848758  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001146  hypothetical protein  23.08 
 
 		 724 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  26.17 
 
 		 790 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  24.2 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.5 
 
 		 725 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  25.77 
 
 		 664 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  24.83 
 
 		 770 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  24.2 
 
 		 717 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  24.2 
 
 		 717 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  24.2 
 
 		 717 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  24.2 
 
 		 717 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.94 
 
 		 730 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  20.79 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  25.86 
 
 		 732 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  24.54 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  23 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.23 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  25.64 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  23.78 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.39 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  23.86 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  23.86 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.87 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.86 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  23.78 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  23.86 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  23.78 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  23.86 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25.68 
 
 		 711 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  28.03 
 
 		 726 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  27.01 
 
 		 345 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  24.06 
 
 		 649 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  23.51 
 
 		 720 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.87 
 
 		 738 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.71 
 
 		 746 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  24.43 
 
 		 730 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.16 
 
 		 806 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  26.86 
 
 		 345 aa  43.9  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>