18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0928 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0928  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  337  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00442924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1389  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  43.86 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  36.92 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  32.95 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  39.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 104 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  36.51 
 
 		 264 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  36.51 
 
 		 264 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1242  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 254 aa  40.8  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.471276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 115 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>