137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0371 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0371  putative oxidoreductase  100 
 
 		 356 aa  730    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3617  putative oxidoreductase  62.89 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0110465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0282  putative oxidoreductase  58.5 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3902  putative oxidoreductase  54.05 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5123  putative oxidoreductase  53.76 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4200  putative oxidoreductase  53.76 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4056  putative oxidoreductase  53.47 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  53.47 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0013  putative oxidoreductase  53.18 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  53.47 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0013  putative oxidoreductase  53.18 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.8 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.87 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.73 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.07 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.49 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.94 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.81 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.94 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  22.52 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.31 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.68 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  24.07 
 
 		 547 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  24.86 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.01 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  23.28 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  22.36 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  21.85 
 
 		 570 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  21.85 
 
 		 570 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.63 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  22.48 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  23.7 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.5 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.62 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  22.15 
 
 		 565 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  23.13 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.16 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  22.71 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  22.04 
 
 		 457 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  24.02 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.42 
 
 		 584 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  26.78 
 
 		 600 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.16 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.09 
 
 		 507 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  20.5 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.32 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25 
 
 		 529 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  21.89 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  22.22 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  26.79 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>