23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0108 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0108  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1035    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0110  hypothetical protein  92.9 
 
 
520 aa  915    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1797  hypothetical protein  48.78 
 
 
368 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1516  hypothetical protein  48.17 
 
 
370 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.227418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1568  hypothetical protein  37.42 
 
 
291 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00354589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2761  hypothetical protein  33.99 
 
 
288 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4132  hypothetical protein  33.1 
 
 
272 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4171  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0571677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4194  hypothetical protein  33.1 
 
 
288 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4284  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4083  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000236834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3818  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3803  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3973  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3892  hypothetical protein  32.39 
 
 
288 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1067  hypothetical protein  33.1 
 
 
288 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  0.659791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0383  protein of unknown function DUF1002  35.37 
 
 
292 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2241  protein of unknown function DUF1002  34.02 
 
 
296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000812091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2358  hypothetical protein  29.94 
 
 
303 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1524  protein of unknown function DUF1002  27.44 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.759287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0097  hypothetical protein  28.01 
 
 
322 aa  77  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152524 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0963  hypothetical protein  28.85 
 
 
320 aa  63.9  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0450638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1253  hypothetical protein  33.1 
 
 
322 aa  61.6  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>