More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1477 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1414  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1477  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000138575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  60.53 
 
 
194 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  60.53 
 
 
194 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
182 aa  190  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  59.21 
 
 
194 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  58.44 
 
 
180 aa  187  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 
184 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
178 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  59.33 
 
 
178 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  60.67 
 
 
202 aa  185  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  59.09 
 
 
159 aa  184  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 
156 aa  183  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56 
 
 
155 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  62.34 
 
 
177 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 
185 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  55.84 
 
 
190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  55.84 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 
171 aa  178  4e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  56 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  59.29 
 
 
147 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  61.04 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
147 aa  177  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  55.33 
 
 
177 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 
151 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  61.04 
 
 
177 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  56.67 
 
 
173 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  61.04 
 
 
177 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.67 
 
 
192 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  56.08 
 
 
173 aa  174  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  56 
 
 
178 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  59.74 
 
 
177 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  55.33 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  55.19 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  59.74 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  59.74 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  57.82 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 
178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  58 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0877  translation initiation factor IF-3  60.65 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000348215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
174 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 
179 aa  171  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 
165 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  60.15 
 
 
137 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 
156 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  60.31 
 
 
137 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  56.67 
 
 
169 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 
156 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1141  initiation factor 3  61.84 
 
 
152 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 
180 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 
156 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
181 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  55.92 
 
 
182 aa  168  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  58.06 
 
 
180 aa  167  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 
173 aa  167  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  54.67 
 
 
175 aa  167  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  58.06 
 
 
180 aa  167  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  54.67 
 
 
178 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  58.06 
 
 
180 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
192 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  51.3 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 
180 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 
180 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
156 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 
173 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  59.59 
 
 
146 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 
156 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  58.71 
 
 
180 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  56.67 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0913  translation initiation factor IF-3  60.67 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  55.1 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 
169 aa  164  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1713  translation initiation factor IF-3  57.59 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.33 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  54.55 
 
 
205 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 
238 aa  160  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 
171 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>