13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01110 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01110  expressed protein  100 
 
 
665 aa  1347    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06480  hypothetical protein  21.02 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01540  expressed protein  22.52 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0523  putative lipoprotein  25.55 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0632  putative lipoprotein  25.55 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1351  hypothetical protein  25.55 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.625365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4316  putative lipoprotein  25.83 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280453  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1554  putative lipoprotein  24.57 
 
 
489 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01750  expressed protein  22.04 
 
 
532 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.901419  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10868  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1742  hypothetical protein  25 
 
 
670 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1579  putative lipoprotein  24.93 
 
 
474 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  24.49 
 
 
642 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>