252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00860 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00860  conserved hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  764    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01379  Putative uncharacterized proteinSONA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74224]  47.92 
 
 
362 aa  343  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.389246  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77577  predicted protein  44.6 
 
 
365 aa  335  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140493  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12608  predicted protein  40.73 
 
 
345 aa  285  9e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000194885  normal  0.0659856 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24439  predicted protein  36.71 
 
 
357 aa  236  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02439  Spindle assembly checkpoint protein SLDB [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59902]  29.1 
 
 
357 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13201  predicted protein  26.88 
 
 
322 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0928133 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25941  predicted protein  26.9 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0246971 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02770  conserved hypothetical protein  28 
 
 
520 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32949  WD40 mitotic checkpoint-like protein similar to spleen mitotic checkpoint BUB3  27.27 
 
 
397 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57023  cell cycle arrest protein  25.73 
 
 
366 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.1 
 
 
919 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
1363 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  22.47 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.07 
 
 
1240 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.5 
 
 
1553 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 
947 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.12 
 
 
1357 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 
1161 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 
1161 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
865 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.43 
 
 
1552 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 
1211 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.29 
 
 
737 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.1 
 
 
1304 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.54 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.82 
 
 
576 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.47 
 
 
1163 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.1 
 
 
1652 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.3 
 
 
1789 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.79 
 
 
1477 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.5 
 
 
1188 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.74 
 
 
1236 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.86 
 
 
696 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  25.93 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  23.84 
 
 
652 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
1557 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 
1711 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.02 
 
 
1510 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 
1411 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.44 
 
 
833 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.82 
 
 
924 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.26 
 
 
1481 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.61 
 
 
664 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.13 
 
 
1398 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01270  cytoplasm protein, putative  29.06 
 
 
314 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00000980241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  32.37 
 
 
1183 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 
1229 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.72 
 
 
657 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 
1858 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.74 
 
 
1599 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 
1209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.36 
 
 
1523 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 
1760 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
1474 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.15 
 
 
842 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 
1656 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.51 
 
 
1348 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.35 
 
 
1217 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.11 
 
 
757 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 
740 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.52 
 
 
930 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.4 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 
1443 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.67 
 
 
1661 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.71 
 
 
1617 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24 
 
 
1242 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.83 
 
 
1164 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.71 
 
 
675 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.52 
 
 
1213 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 
565 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.57 
 
 
1196 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.86 
 
 
1399 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.89 
 
 
1221 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.6 
 
 
443 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.4 
 
 
1262 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  20.88 
 
 
511 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.75 
 
 
1267 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.91 
 
 
1364 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.79 
 
 
1598 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.26 
 
 
1583 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  29.2 
 
 
684 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04163  GBLP_NEUCR Guanine nucleotide-binding protein beta subunit-like protein (Cross-pathway control WD-repeat protein cpc-2)Gbeta like protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGV7]  27.94 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22.11 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  29.6 
 
 
489 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
1766 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.76 
 
 
1454 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 
1367 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.23 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_311  predicted protein  24.5 
 
 
833 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.122564  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 
589 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  20.44 
 
 
1344 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 
1714 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.38 
 
 
1193 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  25.73 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
1686 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.79 
 
 
1039 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  23.41 
 
 
522 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>