More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00600 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00600  galactose metabolism-related protein, putative  100 
 
 		 390 aa  805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.111789  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06760  galactose metabolism-related protein, putative  66.93 
 
 		 373 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.457965  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  44.74 
 
 		 688 aa  313  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  43.97 
 
 		 358 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  45.41 
 
 		 337 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  44.2 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27190  predicted protein  43.16 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 342 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  44.35 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  45.41 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  43.67 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04727  UDP-glucose 4-epimerase (Eurofung)  45.19 
 
 		 371 aa  298  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  44.05 
 
 		 338 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  43.51 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  43.78 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  41.98 
 
 		 348 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  44.59 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  44.09 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  44.09 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  44.32 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  42.13 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  43.43 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  43.82 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 337 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  43.55 
 
 		 339 aa  291  9e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  43.13 
 
 		 337 aa  292  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  42.7 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  42.86 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  43.51 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  42.71 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  42.97 
 
 		 336 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  43.97 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  44.05 
 
 		 337 aa  289  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  43.82 
 
 		 337 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  42.47 
 
 		 335 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  42.74 
 
 		 338 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  43.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  46.24 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  41.24 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 342 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  41.24 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  42.47 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  42.43 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  41.24 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  44.32 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  43.55 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  42.05 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  40.7 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  41.38 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  42.09 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  42.74 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  41.82 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 344 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  42.82 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  42.51 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  42.7 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  42.05 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  40.81 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  42.2 
 
 		 338 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  41.44 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  41.4 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  41.67 
 
 		 343 aa  279  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  42.74 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  40.21 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  42.47 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  40.91 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  41.89 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  40.91 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 337 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  41.13 
 
 		 340 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  41.51 
 
 		 337 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  42.67 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  40.97 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  42.82 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  40.7 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>