9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06710 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06710  tRNA-Lys  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00000989246  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01240  tRNA-Lys  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01610  tRNA-Lys  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0165954  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04040  tRNA-Lys  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.461122  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03530  tRNA-Lys  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00180  tRNA-Lys  99.07 
 
 
108 bp  206  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNL02220  tRNA-Lys  84.03 
 
 
119 bp  87.7  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>