15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00890 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ00890  ER to Golgi transport-related protein, putative  100 
 
 		 315 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01117  COPII-coated vesicle protein SurF4/Erv29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11770)  61.46 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68974  predicted protein  45.76 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  30.23 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.69 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  41.03 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  25.55 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  25.55 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  33.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.07 
 
 		 152 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  30.48 
 
 		 145 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  30.48 
 
 		 145 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  30.68 
 
 		 133 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>