8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00350 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00350  opsin 1, putative  100 
 
 
328 aa  650    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.534586  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03361  putative bacteriorhodopsin /opsin, nopA (Eurofung)  28.77 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.553443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3441  rhodopsin  26.4 
 
 
233 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000429167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2037  rhodopsin  28.76 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0315  rhodopsin  23.02 
 
 
251 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0839724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0537  rhodopsin  24.57 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326912  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1057  rhodopsin  27.2 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.307304  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2680  rhodopsin  26.71 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>