More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00900 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE00900  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 401 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.957355  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06191  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11720)  36.2 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.662409  decreased coverage  0.00296342 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44069  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.550726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.97 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.69 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  30.75 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.7 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 323 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.34 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 		 335 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.77 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.11 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.17 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.94 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  31.37 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  30.26 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.71 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.64 
 
 		 324 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  35.81 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.35 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.5 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  35.25 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.54 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  30.75 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.24 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  30.33 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.69 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.15 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.15 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  34.02 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  29.27 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  36.32 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.61 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  35.09 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  31.27 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  30.91 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  29.29 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  25.49 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  31.2 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.9 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.57 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.57 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  33.2 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  33.2 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  34.21 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.76 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  32.85 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.96 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.79 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  29.63 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.79 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.03 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  27.49 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.79 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  27.37 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  27.76 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  27.49 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  32.55 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  29.11 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.33 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  32.49 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  33.19 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.74 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  25.93 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  26.55 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  32.02 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  33.63 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  31.9 
 
 		 363 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  32.42 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  26.67 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  27.96 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  32.75 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  32.05 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  32.17 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  31.06 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>