22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04290 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04290  conserved hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.546532  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11411  40S ribosomal protein S29 (Eurofung)  70.91 
 
 
56 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992589  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  69.09 
 
 
56 aa  84  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42310  Ribosomal protein S29, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.93 
 
 
56 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.243143  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28147  predicted protein  45.45 
 
 
62 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0241  30S ribosomal protein S14P  52.08 
 
 
54 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  46.67 
 
 
47 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  46.67 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  53.33 
 
 
53 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  41.07 
 
 
56 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  44.44 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1842  ribosomal protein S14  51.06 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  41.07 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  41.67 
 
 
51 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  48.89 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  48.89 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  48.89 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  41.67 
 
 
51 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0177  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1764  ribosomal protein S14  47.73 
 
 
54 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.351928  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1258  30S ribosomal protein S14P  47.73 
 
 
54 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2010  30S ribosomal protein S14P  45.45 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.866444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>