20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06360 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06360  60s ribosomal protein l7, putative  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07107  60S ribosomal protein L7 (AFU_orthologue; AFUA_4G03880)  64.52 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135694  normal  0.632597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  56.41 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  56.36 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  44.3 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14450  predicted protein  38.36 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62698  predicted protein  34.57 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.0000253045  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  30.38 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  28.22 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  28.82 
 
 		 179 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  25.47 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  27.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  27.43 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  28.89 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  35.23 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  25.31 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  25.62 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  26.01 
 
 		 175 aa  45.8  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  35.71 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  25.62 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>