13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1736 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.564825  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1736  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000554415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1158  tRNA-Arg  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00837933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0516  tRNA-Glu  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2180  tRNA-Glu  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2184  tRNA-Glu  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2217  tRNA-Glu  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2261  tRNA-Glu  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.194341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0038  tRNA-Glu  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00419893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>