25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0041 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0041  membrane protein, putative, degenerate  100 
 
 		 93 aa  191  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1319  S-adenosylmethionine synthetase  78.69 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3212  protein of unknown function DUF1440  41.18 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.269877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3317  protein of unknown function DUF1440  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00249  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0333  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0313  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0362655  hitchhiker  0.00720742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3332  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0298  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00246  conserved inner membrane protein  38.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4729  inner membrane protein YagU  35.87 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0463  hypothetical protein  42.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00263232  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1474  hypothetical protein  32.94 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0508  protein of unknown function DUF1440  37.65 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2282  hypothetical protein  34.12 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4657  inner membrane protein YagU  36.96 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4667  inner membrane protein YagU  36.96 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0429  hypothetical protein  57.14 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0171  hypothetical protein  36.07 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0166  hypothetical protein  36.07 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0911  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0766  hypothetical protein  31.25 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0851  hypothetical protein  32.81 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1837  periplasmic/secreted protein  35.19 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000159853  normal  0.231826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3478  protein of unknown function DUF1440  47.5 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>