25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tArg01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tArg01  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0074  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.214945  normal  0.0186415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0072  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0596228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0075  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336588  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0073  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334758  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0047  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13666  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt25  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.552192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0066  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352817  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt26  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>