More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2169 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2169  transposase  100 
 
 		 124 aa  260  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2305  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2322  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2538  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2543  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.66662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3056  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3282  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3616  IS3 family transposase  100 
 
 		 246 aa  259  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1881  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 256 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4443  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 256 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  47.58 
 
 		 405 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 239 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 201 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 227 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 201 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 227 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 227 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 201 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 201 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  46.77 
 
 		 227 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  49.19 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 242 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  46.77 
 
 		 275 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  46.77 
 
 		 275 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  46.77 
 
 		 275 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 268 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 240 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  45.97 
 
 		 275 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  45.97 
 
 		 275 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 242 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 242 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 287 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 287 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 287 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  46.77 
 
 		 411 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  46.77 
 
 		 411 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  46.77 
 
 		 411 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  46.77 
 
 		 411 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  46.77 
 
 		 411 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  48.8 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2077  IS3 family transposase orfB  46.77 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 265 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 265 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 265 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 265 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00385  ISPsy11, transposase OrfB  44.35 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.19581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  45.97 
 
 		 263 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2471  IS3 family transposase orfB  45.97 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.944113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  45.16 
 
 		 266 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  47.58 
 
 		 242 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  45.16 
 
 		 263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  45.16 
 
 		 272 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  45.16 
 
 		 265 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 255 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 255 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 267 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.125694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>