73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1939 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1939  deoxyhypusine synthase  100 
 
 
324 aa  680    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.952214  normal  0.0341387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0287  deoxyhypusine synthase  88.47 
 
 
326 aa  584  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  0.0769858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0490  deoxyhypusine synthase  82.41 
 
 
324 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1873  deoxyhypusine synthase  79.88 
 
 
324 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2810  deoxyhypusine synthase  82.19 
 
 
322 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00515  hypothetical protein  77.67 
 
 
324 aa  518  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2448  deoxyhypusine synthase  70.06 
 
 
325 aa  494  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2079  deoxyhypusine synthase  68.62 
 
 
325 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.362575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3346  deoxyhypusine synthase  69.44 
 
 
325 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3460  deoxyhypusine synthase  71.21 
 
 
324 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0388485  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1628  deoxyhypusine synthase  67.89 
 
 
348 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1218  deoxyhypusine synthase  68.52 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3399  deoxyhypusine synthase  68.83 
 
 
326 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3135  deoxyhypusine synthase  63.55 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3197  deoxyhypusine synthase  54.4 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3292  deoxyhypusine synthase  54.4 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3097  deoxyhypusine synthase  53.77 
 
 
340 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0029  putative deoxyhypusine synthase  26.79 
 
 
311 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1276  deoxyhypusine synthase-like protein  26.65 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1485  deoxyhypusine synthase  27.91 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0390114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0184  putative deoxyhypusine synthase  25.41 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2480  deoxyhypusine synthase-like protein  27.97 
 
 
349 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4976  deoxyhypusine synthase-like protein  26.75 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2876  deoxyhypusine synthase-like protein  27.27 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1896  deoxyhypusine synthase-like protein  27.66 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0708136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2089  deoxyhypusine synthase-like protein  27.02 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0154  putative deoxyhypusine synthase  25.08 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.124877  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1464  deoxyhypusine synthase-like protein  25.72 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.781396  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2484  deoxyhypusine synthase-like protein  26.48 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  26.76 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2235  deoxyhypusine synthase-like protein  25.96 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0578159  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1200  putative deoxyhypusine synthase  24.51 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0073  deoxyhypusine synthase-like protein  26.22 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1942  deoxyhypusine synthase  28.23 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2038  putative deoxyhypusine synthase  26.73 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.1291  normal  0.264826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1180  putative deoxyhypusine synthase  28.34 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3109  deoxyhypusine synthase  25.95 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0928  deoxyhypusine synthase-like protein  24.62 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.646253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0061  putative deoxyhypusine synthase  24.91 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1312  deoxyhypusine synthase  24.32 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0118819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2349  putative deoxyhypusine synthase  25.73 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2546  putative deoxyhypusine synthase  25 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.482649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1329  putative deoxyhypusine synthase  25 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.644418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2574  putative deoxyhypusine synthase  24.03 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0839  deoxyhypusine synthase-like protein  25.63 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0732  deoxyhypusine synthase-like protein  25.63 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3738  Deoxyhypusine synthase  23.86 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1997  putative deoxyhypusine synthase  24.23 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.428923  normal  0.191458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1946  Deoxyhypusine synthase  25.08 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305286  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0166  deoxyhypusine synthase-like protein  24.84 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0257  deoxyhypusine synthase-like protein  25.89 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4663  deoxyhypusine synthase-like protein  24.65 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1799  putative deoxyhypusine synthase  23.78 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2389  putative deoxyhypusine synthase  23.45 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1753  putative deoxyhypusine synthase  23.59 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000310195  normal  0.0979592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1171  putative deoxyhypusine synthase  21.65 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0413  putative deoxyhypusine synthase  20.63 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2903  putative deoxyhypusine synthase  24.11 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0376  deoxyhypusine synthase-like protein  22.08 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1970  putative deoxyhypusine synthase  22.11 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0783  putative deoxyhypusine synthase  21.2 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.363261  normal  0.028647 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0041  deoxyhypusine synthase  22.79 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1868  deoxyhypusine synthase  22.77 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88952  predicted protein  21.68 
 
 
379 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64572  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46999  predicted protein  21.97 
 
 
420 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.970399  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0861  putative deoxyhypusine synthase  20.4 
 
 
292 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0976  putative deoxyhypusine synthase  20.21 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1473  putative deoxyhypusine synthase  23.32 
 
 
342 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333563  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0648  putative deoxyhypusine synthase  21.2 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35514  predicted protein  25.81 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0201246  normal  0.36566 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02480  deoxyhypusine synthase, putative  21.45 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0815  putative deoxyhypusine synthase  19.64 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1142  putative deoxyhypusine synthase  18.98 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.280864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>