125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1528 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1528  transposase  100 
 
 		 449 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0027095  normal  0.119648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  28.48 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  26.95 
 
 		 275 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  26.95 
 
 		 275 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  26.95 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  26.95 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  26.95 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  27.66 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 242 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  28.25 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  27.71 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  25.3 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  25.9 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  26.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  26.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  26.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  26.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  26.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1229  ISSdy1, transposase OrfB  27.27 
 
 		 259 aa  47  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0649083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  25.79 
 
 		 295 aa  46.6  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  25.66 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  26.9 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  25.3 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  26.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  27.01 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  27.01 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  27.01 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6760  Integrase catalytic region  29.09 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4293  integrase catalytic subunit  25.66 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.942529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  26.9 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>