51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0691 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0691  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  25.44 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0365  protein of unknown function DUF542, ScdA-like  28.9 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.65621  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  27.27 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1251  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.99 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.964193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4124  hypothetical protein  25.11 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3032  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  24.78 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3576  hypothetical protein  26.56 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.421101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.7 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3967  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.18 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.42 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1582  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  25 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3989  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.42 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3700  hypothetical protein  22.78 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3236  hypothetical protein  24.26 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3890  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.67 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4083  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.74 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0155994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.25 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.25 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0383  hypothetical protein  24.6 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0432  hypothetical protein  22.92 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0203257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4057  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.36 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0199  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  21.61 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  22.59 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4302  hypothetical protein  24.68 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1827  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  23.5 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0328  hypothetical protein  24.27 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203423  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0450  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.29 
 
 
177 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4649  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  22.29 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  0.343196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0849  hypothetical protein  22.12 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2293  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  24.12 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00571035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2414  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.46 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2153  ScdA protein  24.28 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2178  ScdA protein  24.29 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2035  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  23.14 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2147  ScdA protein  24.29 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1950  cell division and morphogenesis-related protein  24.29 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0219264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1998  ScdA protein  24.29 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00228936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3161  ScdA protein  23.39 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.284126  normal  0.196192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1168  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  25.97 
 
 
232 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1991  hypothetical protein  22.81 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0753  scdA protein, putative  25.45 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00120988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3494  hemerythrin HHE cation binding region  23.31 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1971  cell division and morphogenesis-related protein  22.94 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0041532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2294  ScdA protein  21.76 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.208436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0777  putative scdA protein  39.29 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000142333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0730  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  22.66 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2769  protein of unknown function DUF542, ScdA-like protein  21.91 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.381543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1824  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  21.94 
 
 
231 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0324  cell wall biosynthesis protein ScdA  22.73 
 
 
224 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>