12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0484 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0484  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0667  hypothetical protein  33.13 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1432  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000493238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3604  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4663  hypothetical protein  33.12 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2045  hypothetical protein  27.85 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.569205  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1218  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01040  hypothetical protein  30.38 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4489  hypothetical protein  24.71 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109941  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1208  hypothetical protein  31.48 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0580  hypothetical protein  25.93 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00704524  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0809  hypothetical protein  26.75 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>