14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0393 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0393  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 409 aa  812    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00119924  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  22.35 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 477 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  30.4 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 835 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.14 
 
 		 1128 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  28.16 
 
 		 496 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  22.41 
 
 		 762 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 651 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 604 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>