263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1676 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1676  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2230  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2194  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000558715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  89.29 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0023  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.234998  normal  0.014223 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1915  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000764546  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0277  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.5301700000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.27 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  87.27 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  87.27 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  87.27 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  87.27 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  90.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  90.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.929187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>