220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0866 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0866  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
1124 aa  2250    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0935  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  52.35 
 
 
741 aa  434  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.993147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  47.76 
 
 
741 aa  396  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  53.33 
 
 
739 aa  389  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.09 
 
 
744 aa  366  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0792  transcriptional regulatory protein HypF  44.26 
 
 
732 aa  344  5.999999999999999e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0531432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.07 
 
 
781 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.33 
 
 
780 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.58 
 
 
800 aa  325  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1837  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.81 
 
 
758 aa  323  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  33.46 
 
 
771 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.11 
 
 
766 aa  308  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.86 
 
 
758 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0725  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  50.34 
 
 
729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.45 
 
 
783 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.65 
 
 
775 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0651  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  49.66 
 
 
728 aa  303  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1047  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  49.32 
 
 
729 aa  303  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0365052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  36.52 
 
 
808 aa  301  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  38.49 
 
 
742 aa  300  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.34 
 
 
835 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.68 
 
 
838 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.83 
 
 
778 aa  298  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.7 
 
 
836 aa  297  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.1 
 
 
837 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.7 
 
 
818 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.49 
 
 
840 aa  294  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.1 
 
 
840 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.71 
 
 
801 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  37.18 
 
 
786 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.64 
 
 
803 aa  292  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.78 
 
 
741 aa  290  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  35.07 
 
 
776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.7 
 
 
779 aa  287  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.47 
 
 
792 aa  287  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  31.14 
 
 
803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.14 
 
 
803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3185  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.9 
 
 
751 aa  286  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.5 
 
 
769 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  37.17 
 
 
776 aa  284  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  37.17 
 
 
776 aa  284  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  30.22 
 
 
778 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.91 
 
 
781 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.88 
 
 
764 aa  281  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.94 
 
 
773 aa  279  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.26 
 
 
763 aa  279  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  36.89 
 
 
767 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.77 
 
 
766 aa  278  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.4 
 
 
785 aa  278  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.5 
 
 
758 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.42 
 
 
754 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1385  hydrogenase maturation protein HypF  35.93 
 
 
753 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.32 
 
 
777 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.44 
 
 
762 aa  276  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.16 
 
 
736 aa  275  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.92 
 
 
763 aa  275  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.12 
 
 
773 aa  274  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.35 
 
 
776 aa  274  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  44.25 
 
 
763 aa  273  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  28.29 
 
 
783 aa  273  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.22 
 
 
784 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.55 
 
 
773 aa  272  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.01 
 
 
779 aa  269  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.51 
 
 
762 aa  268  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47 
 
 
780 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.36 
 
 
758 aa  268  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  30.59 
 
 
755 aa  268  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  33.26 
 
 
812 aa  267  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.42 
 
 
852 aa  267  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.86 
 
 
781 aa  262  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.87 
 
 
769 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.48 
 
 
773 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.05 
 
 
791 aa  261  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.54 
 
 
740 aa  261  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  42.42 
 
 
760 aa  260  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.15 
 
 
780 aa  260  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  46.62 
 
 
763 aa  260  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.82 
 
 
770 aa  259  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.03 
 
 
781 aa  259  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  30.55 
 
 
785 aa  259  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.32 
 
 
790 aa  258  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1668  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.58 
 
 
770 aa  258  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 
776 aa  258  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  30.44 
 
 
978 aa  257  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.38 
 
 
785 aa  257  7e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.87 
 
 
849 aa  257  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  38.38 
 
 
749 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.24 
 
 
789 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.65 
 
 
740 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.71 
 
 
795 aa  255  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  29.79 
 
 
778 aa  254  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.94 
 
 
816 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36 
 
 
741 aa  254  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.3 
 
 
763 aa  253  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.84 
 
 
770 aa  253  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.6 
 
 
751 aa  253  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.12 
 
 
767 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  28.85 
 
 
757 aa  252  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.98 
 
 
743 aa  251  7e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  35.93 
 
 
763 aa  250  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>