36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1767 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1767  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0136  tRNA-Met  98.44 
 
 		 74 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2088  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.475154  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1764  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2248  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2225  tRNA-Met  96.88 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.357259  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1560  tRNA-Met  96.77 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0025  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.810324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0026  tRNA-Met  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000595128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0023  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0023  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0929841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0027  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309261  tRNA-Met  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0992753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0036  tRNA-Met  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756842  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0015  tRNA-Met  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0848  tRNA-Asp  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.473747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0018  tRNA-Met  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000031299  normal  0.0565346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0041  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0086  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0294  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla01  tRNA-Ala  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154923  hitchhiker  0.00246216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13674  tRNA-His  96.15 
 
 		 70 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>