87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1276 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1276  inner membrane protein YjcH  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0005  hypothetical protein  42.45 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.205658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  40.26 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  40.26 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  38.96 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  40.26 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  41.1 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  35.16 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  36.56 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  36.56 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  38.04 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  38.04 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  36.56 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  38.04 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  40.51 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  37.08 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  39.24 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  35.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  41.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  37.08 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  29.35 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  29.35 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  32.91 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  37.97 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  35.16 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25240  DUF485 family protein  34.44 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  37.18 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  32.47 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  37.18 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2930  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  37.18 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2792  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6217  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  33.77 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  35.9 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  35.9 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3376  protein of unknown function DUF485  41.05 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  30.68 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0397  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  33.77 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  31.88 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  25.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  25.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  25.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  32.47 
 
 		 666 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  35.44 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  32.5 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  31.17 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  32.97 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2875  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  25.84 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2261  hypothetical protein  29.89 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2886  hypothetical protein  28.74 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  29.21 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  28.21 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4961  hypothetical protein  28.21 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249965  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  35.11 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0275  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>