30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1108 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1108  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.719213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0827  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  74.24 
 
 		 348 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  74.24 
 
 		 348 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.860784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0725  extracellular solute-binding protein family 1  58.54 
 
 		 350 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  60.71 
 
 		 352 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0746  extracellular solute-binding protein family 1  58.54 
 
 		 350 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  58.82 
 
 		 354 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  58.82 
 
 		 354 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1332  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  74.14 
 
 		 352 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0623244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  60.71 
 
 		 352 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1027  hypothetical protein  58.43 
 
 		 355 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  58.82 
 
 		 354 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000661  putative periplasmic solute-binding protein  70.31 
 
 		 355 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.5 
 
 		 354 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  57.97 
 
 		 359 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4488  extracellular solute-binding protein  77.55 
 
 		 353 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  65.62 
 
 		 355 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  65.62 
 
 		 355 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  48.48 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1234  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  42.86 
 
 		 414 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0793  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  42.11 
 
 		 410 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.295736  normal  0.158194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2637  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3334  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5127  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1380  ABC polyamine/opine/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.5 
 
 		 382 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5216  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5507  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2897  extracellular solute-binding protein family 1  33.82 
 
 		 367 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0984  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 366 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>