More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1741 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  100 
 
 
132 aa  265  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  88.64 
 
 
132 aa  236  9e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  71.43 
 
 
130 aa  180  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  61.72 
 
 
132 aa  158  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  55.47 
 
 
129 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  55.47 
 
 
129 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  54.69 
 
 
129 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  52.38 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.14 
 
 
130 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.83 
 
 
130 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  33.61 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.48 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  39.52 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  33.61 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  34.43 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.62 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  35.77 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  34.33 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.2 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  34.4 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  33.06 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  34.4 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  33.87 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  33.87 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  33.88 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  33.88 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  33.06 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  33.88 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  30.65 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  33.88 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  33.6 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  30.83 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  33.06 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  32.31 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  31.36 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  32.5 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  33.61 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  32.79 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  33.06 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  30.65 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  32.82 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  31.5 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  30.47 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  31.71 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  32.23 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  31.71 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  31.5 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  29.75 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.01 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  31.5 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  31.75 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  30.08 
 
 
152 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  31.75 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  30 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  31.15 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1810  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
157 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4149  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0266463  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1713  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.2 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  hitchhiker  0.0021985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  30.16 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  32.56 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  30.33 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>