More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0817 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0817  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
406 aa  816    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000422282  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1160  putative FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
404 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
415 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
418 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.97 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  27.23 
 
 
416 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  24.94 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  27.41 
 
 
401 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  24.77 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.14 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
420 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.13 
 
 
421 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
415 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1999  D-amino-acid dehydrogenase  25.25 
 
 
403 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  25.84 
 
 
424 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.95 
 
 
418 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  23.54 
 
 
417 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.42 
 
 
416 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.18 
 
 
416 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  24.64 
 
 
421 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.48 
 
 
433 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0223  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.92 
 
 
445 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.21 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  26.2 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.2 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5290  D-amino-acid dehydrogenase  24.03 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.4 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.57 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5580  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.92 
 
 
422 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  25.12 
 
 
434 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  25.3 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  24.23 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.39 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  22.7 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.18 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.18 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  23.19 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  24.94 
 
 
417 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  22.91 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.32 
 
 
432 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  22.52 
 
 
417 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.03 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.32 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.71 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  20.57 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6408  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6641  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  23.8 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.76 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6239  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 
414 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
427 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
408 aa  87  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.72 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.68 
 
 
425 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.97 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  25.42 
 
 
418 aa  86.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  23.92 
 
 
422 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  86.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.23 
 
 
428 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  24.17 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.49 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.49 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.05 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.49 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  23.26 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  23.26 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  24.77 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.73 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.73 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  22.72 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.57 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.44 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.57 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.73 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  20.73 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  24.03 
 
 
463 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  23.98 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>