128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1088 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1465  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.54 
 
 
740 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00781151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4012  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.19 
 
 
741 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1354  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.24 
 
 
741 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3100  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.27 
 
 
739 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0635  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50 
 
 
734 aa  702    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.707304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2629  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.13 
 
 
741 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3356  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.78 
 
 
743 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3186  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  45.78 
 
 
740 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467142  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04530  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  47.21 
 
 
740 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19690  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  46.53 
 
 
741 aa  670    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.00582457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4201  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  45.63 
 
 
747 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3594  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  45.37 
 
 
741 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5855  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  45.43 
 
 
742 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0781482  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0459  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  47.68 
 
 
741 aa  670    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1410  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  45.22 
 
 
741 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1359  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  47.81 
 
 
740 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000634164  hitchhiker  8.074690000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1101  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.27 
 
 
739 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1721  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.19 
 
 
743 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2227  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.32 
 
 
743 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2203  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.77 
 
 
739 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.199816  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1324  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.36 
 
 
743 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000574496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1684  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  45.9 
 
 
742 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000025647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0532  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  45.49 
 
 
742 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1831  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.13 
 
 
740 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.774798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0525  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.78 
 
 
744 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0755459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37720  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  46.83 
 
 
736 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0949235  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3729  isocitrate dehydrogenase  45.22 
 
 
747 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2205  isocitrate dehydrogenase [NADP]  45.83 
 
 
742 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1912  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.84 
 
 
742 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1648  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.05 
 
 
743 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2377  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.46 
 
 
743 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00123907  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1641  isocitrate dehydrogenase  46.1 
 
 
737 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1606  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.54 
 
 
741 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.601658  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1681  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.54 
 
 
741 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.642711  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1121  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.14 
 
 
744 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2257  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.13 
 
 
741 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2571  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.7 
 
 
742 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30180  monomeric isocitrate dehydrogenase  45.98 
 
 
741 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1092  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.58 
 
 
740 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2523  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.84 
 
 
742 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0065836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.86 
 
 
740 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0513174  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1750  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.54 
 
 
741 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307688  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0913  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.19 
 
 
730 aa  725    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.280691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0680  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.59 
 
 
741 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3575  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.98 
 
 
737 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2059  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  46.86 
 
 
741 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02366  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.17 
 
 
739 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0983  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.78 
 
 
742 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.614065  normal  0.0628792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1170  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.17 
 
 
739 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0734  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.91 
 
 
739 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.373091  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1089  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.32 
 
 
745 aa  686    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.911582  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0556  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.86 
 
 
767 aa  700    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2475  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.96 
 
 
741 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00185423  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0970  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.21 
 
 
735 aa  664    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1563  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.93 
 
 
739 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.37594  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2230  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.37 
 
 
741 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2397  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.56 
 
 
742 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.942581  normal  0.0892636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2181  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.75 
 
 
740 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0711  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  47.68 
 
 
741 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2194  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.22 
 
 
743 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000647255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1821  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.19 
 
 
767 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.111465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2086  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.78 
 
 
739 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28310  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, Icd  45.13 
 
 
741 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  47.36 
 
 
746 aa  674    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0415129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2583  NADP-dependent isocitrate dehydrogenase  45.98 
 
 
741 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2468  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.09 
 
 
741 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00290005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.21 
 
 
744 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1399  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.45 
 
 
767 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1135  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.96 
 
 
732 aa  721    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01563  socitrate dehydrogenase  46.31 
 
 
741 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1088  monomeric isocitrate dehydrogenase  100 
 
 
724 aa  1466    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00133972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1883  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.16 
 
 
741 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.615158  decreased coverage  0.0000000395954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2535  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.15 
 
 
740 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2213  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.45 
 
 
741 aa  656    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0128694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.96 
 
 
741 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.540941  normal  0.0688936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06770  isocitrate dehydrogenase (NADP)  44.81 
 
 
738 aa  640    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0771  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.11 
 
 
741 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318617  hitchhiker  0.000000506151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3617  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.19 
 
 
741 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.162405  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3416  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.87 
 
 
741 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2702  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.84 
 
 
740 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.0232345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2548  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.7 
 
 
742 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00891697  hitchhiker  0.0000000308445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003959  isocitrate dehydrogenase [NADP]  46.72 
 
 
741 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2901  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.04 
 
 
743 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000248362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1876  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.96 
 
 
741 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.436386  hitchhiker  0.0000229787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2442  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.84 
 
 
742 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000648853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3132  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.34 
 
 
741 aa  670    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4080  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.08 
 
 
742 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03994  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.48 
 
 
743 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0694  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.74 
 
 
746 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00369778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0553  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.64 
 
 
741 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1624  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.13 
 
 
742 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00119638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0799  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.53 
 
 
739 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1677  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.53 
 
 
739 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3267  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.51 
 
 
740 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4274  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.03 
 
 
739 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876075  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3680  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.22 
 
 
745 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465452  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5456  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.22 
 
 
747 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897377  normal  0.0127926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2300  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.96 
 
 
744 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288016  hitchhiker  0.00925586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3455  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.91 
 
 
749 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0243949  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0366  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.91 
 
 
744 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>