14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0238 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0238  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09780  carbonic anhydrase  40.74 
 
 
284 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.550137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3292  Barstar (barnase inhibitor)  35.56 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.311666  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0152  YrdF  34.15 
 
 
91 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.363111  hitchhiker  0.0000000066355 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0122  YrdF  34.15 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000773419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3430  hypothetical protein  32.65 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4342  Barstar (barnase inhibitor)  32.26 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1562  Barstar (barnase inhibitor)  34.57 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0033  barstar (barnase inhibitor)  30.36 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  30.56 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0361  Barstar (barnase inhibitor)  31.91 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3227  Barstar (barnase inhibitor)  23.46 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5068  barstar (barnase inhibitor)  34.09 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.069867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5792  barstar (barnase inhibitor)  34.09 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>