37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0046 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0046  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  367  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  35.54 
 
 
520 aa  89  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0044  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  39.05 
 
 
510 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  32 
 
 
545 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  35.29 
 
 
543 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  31.54 
 
 
545 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000430233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  31.54 
 
 
545 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  37.96 
 
 
545 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  31.54 
 
 
545 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000004423  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  37.78 
 
 
509 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  33.54 
 
 
556 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  27.08 
 
 
548 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  33.86 
 
 
539 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  26.39 
 
 
548 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  25.97 
 
 
580 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4349  sulfatase  37.5 
 
 
579 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398112  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  32.32 
 
 
538 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  29.57 
 
 
588 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  29.58 
 
 
551 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  34.04 
 
 
555 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  36.27 
 
 
550 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  29.17 
 
 
576 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1228  sulfatase  29.81 
 
 
569 aa  44.7  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  35.21 
 
 
575 aa  44.7  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  29.49 
 
 
568 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  39.47 
 
 
549 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  31.73 
 
 
544 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  38.55 
 
 
544 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  28.18 
 
 
565 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  32.22 
 
 
552 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  28.18 
 
 
565 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  28.18 
 
 
565 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  28.18 
 
 
565 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1725  sulfatase, putative  32.71 
 
 
512 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  34.72 
 
 
545 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  31.82 
 
 
541 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1142  sulfatase  43.14 
 
 
583 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>