98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t07723 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t07723  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0010  tRNA-Tyr  94.67 
 
 		 85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000473639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0042  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 84 bp  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0072  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 81 bp  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2193  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2231  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000893857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0026  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1328  tRNA-Tyr  92.65 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.044502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  97.67 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0058  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401108  normal  0.738165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  89.55 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  89.55 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0437  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253794  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  88.52 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTyr01  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  91.49 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  89.09 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0013  tRNA-Tyr  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0008  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000521392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t05  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA69  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00000487503  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0055  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000670702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R89  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t09  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000014277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1716  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220424  normal  0.977011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  87.23 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1446  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0015  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  87.23 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0049  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00226201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0077  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000407125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  83.58 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1911  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0172015  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0056  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0021  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0020  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.230904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0006  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000863158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0013  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000305155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  87.76 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  86.96 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>