62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12868 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12868  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4998  O-methyltransferase-like protein  51.35 
 
 
259 aa  276  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0285  O-methyltransferase  43.25 
 
 
266 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.1699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0196  O-methyltransferase-like protein  40.94 
 
 
258 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130485  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6507  O-methyltransferase-like protein  41.18 
 
 
263 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00174248  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0248  O-methyltransferase-like protein  37.8 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000493132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2588  SAM-dependent methyltransferase; O-methyltransferase  30.62 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2215  O-methyltransferase family 3  32.42 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1619  hypothetical protein  36.79 
 
 
217 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1874  hypothetical protein  29.37 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1498  O-methyltransferase family protein  33.87 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0154  O-methyltransferase family protein  31.97 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0514  O-methyltransferase family protein  35.2 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437262  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  30.97 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05830  O-methyltransferase family 3  28.57 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00143828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0807  O-methyltransferase family protein  26.63 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0035936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1671  O-methyltransferase family protein  30.58 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1705  O-methyltransferase family protein  30.58 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.301105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1190  O-methyltransferase family 3  32.06 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0755  O-methyltransferase family protein  29.09 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.078577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1677  O-methyltransferase family protein  30.4 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.498636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2598  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  32.14 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136374  hitchhiker  0.0000823112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2518  O-methyltransferase-like  27.46 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0942  O-methyltransferase family 3  38.16 
 
 
211 aa  52.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2505  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  32.14 
 
 
218 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0398755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07450  O-methyltransferase family protein  28.93 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0754  O-methyltransferase  35.35 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.95723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1057  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.773239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1742  O-methyltransferase family protein  30.99 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  31.48 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  31.48 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  31.48 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1591  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.11 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  28.22 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  28.22 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0598  O-methyltransferase family protein  32.2 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.54088  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0320  O-methyltransferase family protein  31.65 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0491  methyltransferase, putative  27.43 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0734  O-methyltransferase family 3  30.48 
 
 
212 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2932  O-methyltransferase family 3  26.39 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0268348  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  29.6 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2025  O-methyltransferase family protein  30.28 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1776  O-methyltransferase family protein  28.46 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0333  O-methyltransferase family protein  25.81 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1473  O-methyltransferase family 3  27.82 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0273584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0279  O-methyltransferase family 3  26.61 
 
 
207 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  26.83 
 
 
218 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  29.85 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1178  O-methyltransferase family protein  25.42 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  25.62 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  30.56 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1491  hypothetical protein  25.49 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  29.03 
 
 
213 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.262328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2155  O-methyltransferase family 3  35.8 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000364971  hitchhiker  0.00389148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4009  O-methyltransferase family protein  30 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00221471  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  26.83 
 
 
220 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  28.68 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0473  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.11 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2051  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  27.73 
 
 
213 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349011  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4931  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  27.27 
 
 
227 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>