22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11528 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11528  putative alginate lyase  100 
 
 		 310 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.187327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11483  hypothetical protein  40.38 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  32 
 
 		 1556 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  34.69 
 
 		 611 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01238  putative alginate lyase  27.06 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  26.04 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  27.7 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1606  Alginate lyase 2  26.52 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139119  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2839  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  30.11 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000472325  normal  0.357499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  24.55 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.08 
 
 		 524 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3286  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  24.16 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00739048  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  31.45 
 
 		 1554 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3336  Alginate lyase 2  30.65 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3645  alginate lyase  22.82 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.459698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3639  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  20.97 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0665057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1666  hypothetical protein  31.36 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.398713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31810  alginate lyase  28.23 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23960  alginate lyase  30.08 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3520  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41500  putative lyase  26.42 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0508  lyase, putative  24.16 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>