74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08806 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08806  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0278  secreted protein  52.44 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000164081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  54 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09688  hypothetical protein  27.81 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  24.59 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1057 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 987 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1077 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 1050 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09683  hypothetical protein  27.46 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 999 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1099 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1037 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 1035 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  37.97 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 977 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1071 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 757 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1031 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1008 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1059 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 757 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1024 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1040 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  46.77 
 
 		 1109 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1052 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.46 
 
 		 1018 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1047 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1134 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  29.63 
 
 		 853 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1038 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1062 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1136 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1066 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1070 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1023 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  33.93 
 
 		 1025 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  23.63 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  41.27 
 
 		 1189 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  32.32 
 
 		 709 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1144 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 994 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1168 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1010 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 887 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  18.37 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  38.82 
 
 		 1072 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1219 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1065 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1064 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1016 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1084 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1117 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1068 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 1154 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 806 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  28.3 
 
 		 829 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1127 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1043 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1038 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 989 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1188 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 996 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 791 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1135 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 793 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1117 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 962 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 1043 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 933 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1173 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>