More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01805 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01805  PhoR  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0543  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.01 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1223  histidine kinase  43.69 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0457271  hitchhiker  0.00161967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  44.11 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  45.66 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.44 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  38.57 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  38.8 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 592 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 585 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 589 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 582 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.63 
 
 		 575 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 587 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  42.19 
 
 		 587 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  41.77 
 
 		 587 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 585 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  41.77 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  41.35 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  41.77 
 
 		 587 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  41.77 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  41.77 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  41.35 
 
 		 587 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  41.77 
 
 		 587 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 458 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 456 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 594 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 470 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.66 
 
 		 537 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 418 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 607 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 600 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  39.83 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 584 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 584 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 612 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  39.04 
 
 		 591 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 487 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 581 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  39.74 
 
 		 571 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 504 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 593 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 413 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 451 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 460 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 571 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  36.89 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  40.6 
 
 		 571 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 608 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 417 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 639 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  36.28 
 
 		 613 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  35.92 
 
 		 468 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 641 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0992  histidine kinase  41.33 
 
 		 462 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 468 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  37.4 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.69 
 
 		 508 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 611 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 459 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 489 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 484 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 619 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 608 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  36.17 
 
 		 464 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.89 
 
 		 473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.76 
 
 		 470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 466 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 718 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 571 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 609 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 639 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 478 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 639 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 484 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 412 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  35.75 
 
 		 613 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 473 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 484 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 484 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 484 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 763 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 571 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 467 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  36 
 
 		 466 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 613 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>