More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1232 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1232  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 402 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.94 
 
 		 391 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  45.94 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.77 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.26 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.51 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.51 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.51 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  43.51 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  42.2 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  42.49 
 
 		 445 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  40.05 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  40.05 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  39.8 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  40.31 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  39.8 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  39.8 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  39.8 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  40.62 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  40.62 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  40.05 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.1 
 
 		 390 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.58 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  38.48 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  38.73 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  44.44 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  37.38 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  37.23 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  37.69 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.17 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  35.92 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.1 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.1 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  35.92 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.1 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.65 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  35.86 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.75 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  36.36 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.41 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  37.08 
 
 		 430 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  37.08 
 
 		 430 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  37.47 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  35.96 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  37.08 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  36.87 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.14 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  35.26 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.14 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  35.26 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.14 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  36.32 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  36.76 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  36.43 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  36.76 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  36.76 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.47 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  36.76 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  34.76 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  35.95 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  35.96 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  35.28 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.47 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  36.76 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  35.31 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  35.15 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  35.95 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  35.96 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  38.5 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  35.96 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  37.69 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  36.43 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  35.47 
 
 		 386 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  36.43 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  36.2 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  36.78 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  34.26 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  35.68 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  33.49 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  37.08 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  36.87 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  35.07 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  35.07 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  35.07 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  34.86 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  34.44 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  34.44 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  34.37 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  35.13 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>