More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1223 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1223  putative oxidoreductase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4209  (2Fe-2S)-binding domain protein  90.76 
 
 
182 aa  331  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5132  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  79.66 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
218 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1993  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  65.5 
 
 
215 aa  210  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0332  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  63.86 
 
 
229 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0297  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  63.86 
 
 
229 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  57.38 
 
 
226 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00245  predicted xanthine dehydrogenase, 2Fe-2S subunit  63.25 
 
 
229 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  64.07 
 
 
212 aa  207  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00248  hypothetical protein  63.25 
 
 
229 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4261  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.43 
 
 
191 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.793616  normal  0.381135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3318  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.65 
 
 
229 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0292  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.07 
 
 
197 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  56.83 
 
 
225 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3333  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  62.65 
 
 
229 aa  205  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2182  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.58 
 
 
212 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.187261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  61.08 
 
 
211 aa  205  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.41 
 
 
211 aa  204  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.19 
 
 
219 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8335  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.82 
 
 
211 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.71 
 
 
215 aa  201  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3818  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.66 
 
 
253 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.156608  normal  0.115442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0527  twin-arginine translocation pathway signal  62.42 
 
 
227 aa  199  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000232216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4660  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  61.45 
 
 
215 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.67 
 
 
208 aa  198  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.56 
 
 
257 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5490  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.35 
 
 
215 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1133  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  63.41 
 
 
218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2109  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  58.29 
 
 
213 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
240 aa  194  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.68 
 
 
180 aa  194  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  56.83 
 
 
252 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.5 
 
 
214 aa  192  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.83 
 
 
252 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.52 
 
 
246 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.09 
 
 
246 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.18 
 
 
252 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  57.69 
 
 
199 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.67 
 
 
164 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  58.43 
 
 
280 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.39 
 
 
259 aa  187  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  63.19 
 
 
233 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.5 
 
 
173 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.67 
 
 
241 aa  187  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2157  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.5 
 
 
166 aa  187  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4505  twin-arginine translocation pathway signal  60.49 
 
 
224 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  57.41 
 
 
169 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2459  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  62.5 
 
 
157 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  51.79 
 
 
250 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.71 
 
 
168 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  64.43 
 
 
164 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3952  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.73 
 
 
215 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.19 
 
 
251 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4335  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.23 
 
 
262 aa  184  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219943  hitchhiker  0.00586155 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.85 
 
 
236 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.76 
 
 
164 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  61.38 
 
 
168 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  60.26 
 
 
251 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  59.87 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1434  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.6 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1007  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.41 
 
 
264 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4400  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.26 
 
 
198 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.45 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.97 
 
 
249 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3958  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.96 
 
 
216 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0511  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3590  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.15 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.74 
 
 
165 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.74 
 
 
165 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3665  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.35 
 
 
216 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2435  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.38 
 
 
175 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.74315  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1809  (2Fe-2S)-binding  55.62 
 
 
227 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.522511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1318  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  60.69 
 
 
181 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0348872  normal  0.0406737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.94 
 
 
164 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3204  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  55.21 
 
 
173 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.93 
 
 
175 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1537  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.7 
 
 
163 aa  175  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73336  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  59.09 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1593  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.43 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1844  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.21 
 
 
167 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00103565  normal  0.0678401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3743  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  51.15 
 
 
182 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20491  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2669  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.59 
 
 
172 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.221156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0426  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.76 
 
 
173 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.189891  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3943  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.37 
 
 
173 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0439  (2Fe-2S)-binding protein  54.76 
 
 
173 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0758  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.28 
 
 
174 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368608  normal  0.0841181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0449  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.76 
 
 
173 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0103677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4638  (2Fe-2S)-binding  55.7 
 
 
179 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4285  ferredoxin:[2Fe-2S]-binding  58.33 
 
 
176 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678151  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3204  putative oxidoreductase  53.37 
 
 
173 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4484  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.08 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0835  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.67 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.153258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0795  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.67 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.0664969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.74 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.74 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  53.06 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0578  (2Fe-2S)-binding  55.1 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  54.79 
 
 
165 aa  162  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0282  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.8 
 
 
173 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.219522  normal  0.486773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>